据ESI（Essential Science Indicators，基本科学指标）2015年5月7日的最新统计数据（2005年1月1日-2015年2月28日），南京农业大学农业科学领域被ESI数据库收录论文1631篇，总引用次数11988次，全球排名第66位，而同期进入ESI农业科学领域全球大学和科研机构排名前1%的院所为691所，表明我校已经进入全球农业科学领域排名前千分之一的行列，标志着南京农业大学在农业学科领域的研究水平已达到了国际顶尖水平。
近年来，我校发表的学术论文数量和质量不断提升，显示了良好的学术发展态势，进入ESI的学科领域数和各学科领域的排名均呈持续快速上升趋势。目前我校已有4个学科领域进入ESI排名，分别为：农业科学领域（66/691）、植物与动物科学领域(156/1019)、环境生态学领域（500/703）、生物及生物化学领域（659/825）。
ESI是国际上普遍采用的评价学术机构和大学学术水平及影响力的重要指标，基于SCI和SSCI所收录的全球11000多种学术期刊的1000多万条文献记录而建立的计量分析数据库，将全球各个机构在过去十年发表论文的总引用次数，依据所收录文献依所属期刊分别归入22个学科领域进行排名，每两个月滚动更新一次，进入ESI统计的全球大学和科研机构前1%，即为进入ESI，ESI排名前1%的学科一般被视为国际高水平学科，而进入ESI排名前千分之一则更加艰难，所进入学科一般被认为已经达到国际顶尖水平。
