根据教育部科技发展中心最新发布的大学排行榜统计数据，“211工程”建设学校发表的国内论文2001-2003年度被引用次数排序，南京农业大学列居第27位。

    自我校实施科技产出奖励条例以来，科技产出的论文数量和质量逐年攀升，根据2005年度国内“学术榜”统计，我校2004年科技论文被收录976篇，比上年增加171篇，增幅17.5%；我校2005年度科技论文共有216篇被SCI（E）、EI、ISTP收录，比上年增加81篇，增幅60%。