2012年岁末，《南京农业大学学报》喜报频传。继荣获“中国高校精品科技期刊”和“中国科技论文在线优秀期刊二等奖”之后，再次被评为“中国百种杰出学术期刊”，至此，《南京农业大学学报》已7次荣获“中国百种杰出学术期”称号。

2012 年 12 月 7 日 ，科技部中国科技信息研究所在北京国际会议中心召开了“中国科技论文统计结果发布会”，会上发布了“中国百种杰出学术期刊”名单。中国科技信息研究所根据23项学术计量指标，研制了中国科技期刊综合评价指标体系。采用层次分析法，由专家打分确定了重要指标的权重，并分学科对每一种期刊进行综合评定，从近5000种科技期刊中，遴选推出了2011年“中国百种杰出学术期刊”名单，名单涵括中国出版的中英文学术期刊，代表中国学术期刊的最高水平。“中国百种杰出学术期刊”自2002年开始每年评选一次。

另据2012年版《中国科技期刊引证报告》（核心版）统计结果，《南京农业大学学报》各项学术计量指标有较大提升，核心影响因子为0.679，比上一年提高0.125，核心总被引频次1466，他引率0.94，基金论文比0.94。各项学术计量指标综合评价总分排名，在农业大学学报中名列第1位，在全国所有大学学报中排第2位，在全部1998种科技核心期刊中列第67位，名次比上一年提升14位。

中国百种杰出学术期刊