2021年9月14日，南京农业大学英文学术期刊《植物表型组学》（Plant Phenomics）正式被工程索引数据库（EI Compendex）收录。被EI数据库收录，标志着《植物表型组学》这本只有两年半刊龄的期刊，在学术水平、学术影响力以及国际化程度等方面得到了国际学术界的认可。在此前，《植物表型组学》已被CABI、DOAJ、PMC、Scopus和SCIE数据库收录。

《植物表型组学》是由南京农业大学与美国科学促进会（AAAS | Science出版方）合作创办的学术期刊，期刊于2019年1月正式上线发行。期刊采用开放获取形式，刊载植物表型组领域具有突破性科研进展的原创性研究论文、综述、软件/数据库、方法指南和观点等。期刊主编由东京大学Seishi Ninomiya教授、法国国家农业科学院Frédéric Baret研究员和南京农业大学程宗明教授共同担任。2020年入选中国科技期刊卓越行动计划高起点新刊项目，2021年获得国内统一连续出版物号CN32-1898/Q。2021年8月正式被科睿唯安SCIE（Science Citation Index Expanded）数据库收录，同时进入遥感、植物科学和农学三个分区。期刊官网：spj.sciencemag.org/plantphenomics/

南京农业大学英文期刊：

南京农业大学拥有三本英文期刊，除《植物表型组学》外，另有《园艺研究》（Horticulture Research）与《生物设计研究》（BioDesign Research）。

《园艺研究》于2014年1月正式上线发行（www.nature.com/hortres/）。2017年被科睿唯安SCIE数据库收录，2018年入选中国科技期刊国际影响力提升计划D类项目，2019年入选中国科技期刊卓越行动计划领军类期刊项目。JCR2020影响因子6.793，居SCI园艺分区第一，同时位于植物科学和遗传学一区。期刊主编由程宗明教授担任。

《生物设计研究》于2020年4月正式上线发行（spj.sciencemag.org/bdr/）。2020年被DOAJ数据库收录。2021年入选中国科技期刊卓越行动计划高起点期刊项目。美国橡树岭国家实验室Xiaohan Yang高级研究员、英国华威大学Alfonso Jaramillo教授共同担任主编，程宗明教授担任执行主编。